Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFA9Q16795 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms