Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN3Q16667 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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