Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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RPE65Q16518 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPE65Q16518 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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