Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GABRA6Q16445 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GABRA6Q16445 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GABRA6Q16445 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GABRA6Q16445 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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