Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNGA3Q16281 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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