Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TAF11Q15544 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF11Q15544 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms