Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK13Q14004 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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