Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LSAMPQ13449 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms