Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
UBE2V1Q13404 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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