Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF3Q13114 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF3Q13114 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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TRAF3Q13114 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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TRAF3Q13114 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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TRAF3Q13114 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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TRAF3Q13114 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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