Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRJQ12913 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PTPRJQ12913 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRJQ12913 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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