Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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NFIAQ12857 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NFIAQ12857 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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