Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40BQ12829 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RAB40BQ12829 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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