Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PUDPQ08623 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms