Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALD1Q05682 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms