Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3AQ05086 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms