Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CD164Q04900 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms