Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCNT1Q02742 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms