Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LINC02413-202ENST00000552353 898 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 808 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB1Q02641 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms