RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607947.1

SDCBP2-AS1-202, SDCBP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SDCBP2-AS1, Length 808 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.73■■■□□ 2.19
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 FOXD1Q16676 465 aa24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 POTEDQ86YR6 584 aa23.73■■□□□ 1.39
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 MSH5O43196 834 aa23.24■■□□□ 1.31
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ADRA2BP18089 450 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.78■□□□□ 0.92
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.45■□□□□ 0.87
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ABCC9O60706 1549 aa20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.03■□□□□ 0.8
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 RNF39Q9H2S5 420 aa19.79■□□□□ 0.76
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.76■□□□□ 0.75
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.5■□□□□ 0.71
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.34■□□□□ 0.69
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.33■□□□□ 0.68
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 NACADO15069 1562 aa19.29■□□□□ 0.68
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.14■□□□□ 0.65
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.13■□□□□ 0.65
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19■□□□□ 0.63
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.86■□□□□ 0.61
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.61
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.73■□□□□ 0.59
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SCRIBQ14160 1630 aa18.67■□□□□ 0.58
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.54■□□□□ 0.56
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 POTEHQ6S545 545 aa18.48■□□□□ 0.55
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CAPN15O75808 1086 aa18.34■□□□□ 0.53
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DSG3P32926 999 aa18.34■□□□□ 0.53
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.22■□□□□ 0.51
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.14■□□□□ 0.49
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ABCB7O75027 752 aa17.89■□□□□ 0.45
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SLC4A2P04920 1241 aa17.87■□□□□ 0.45
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SMARCA4P51532 1647 aa17.85■□□□□ 0.45
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 NCAPD3P42695 1498 aa17.81■□□□□ 0.44
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.8■□□□□ 0.44
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 APLP2Q06481 763 aa17.78■□□□□ 0.44
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SMARCA2P51531 1590 aa17.77■□□□□ 0.44
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.7■□□□□ 0.42
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 HMGXB3Q12766 1538 aa17.69■□□□□ 0.42
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 KCNA4P22459 653 aa17.69■□□□□ 0.42
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.66■□□□□ 0.42
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 WIZO95785 1651 aa17.51■□□□□ 0.39
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 NESP48681 1621 aa17.41■□□□□ 0.38
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ERCC6Q03468 1493 aa17.41■□□□□ 0.38
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.38■□□□□ 0.37
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.34■□□□□ 0.37
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.3■□□□□ 0.36
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 POLA2Q14181 598 aa17.28■□□□□ 0.36
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.27■□□□□ 0.35
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CUX2O14529 1486 aa17.24■□□□□ 0.35
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.17■□□□□ 0.34
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CFTRP13569 1480 aa17.15■□□□□ 0.34
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.13■□□□□ 0.33
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.09■□□□□ 0.33
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.07■□□□□ 0.32
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.07■□□□□ 0.32
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 WDR62O43379 1518 aa17.01■□□□□ 0.31
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PRDM2Q13029 1718 aa16.97■□□□□ 0.31
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 AKT1S1Q96B36 256 aa16.97■□□□□ 0.31
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.88■□□□□ 0.29
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.85■□□□□ 0.29
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 ABCC8Q09428 1581 aa16.81■□□□□ 0.28
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 TOPBP1Q92547 1522 aa16.8■□□□□ 0.28
SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms