Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MDM2Q00987 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms