Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNAQ00169 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms