Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS29P62273 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
RPS29P62273 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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