Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM3BP58499 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms