Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP3M2P53677 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AP3M2P53677 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms