Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SUCLG1P53597 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms