Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLCSP50747 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLCSP50747 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLCSP50747 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLCSP50747 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLCSP50747 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLCSP50747 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLCSP50747 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLCSP50747 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLCSP50747 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLCSP50747 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms