Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARCN1P48444 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARCN1P48444 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms