Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5OP48047 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5OP48047 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms