Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2IP36954 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms