Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DSG3P32926 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG3P32926 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG3P32926 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSG3P32926 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms