Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASQ1P31415 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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CASQ1P31415 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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CASQ1P31415 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASQ1P31415 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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