Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA9P31269 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA9P31269 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms