Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXP28300 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXP28300 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LOXP28300 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms