Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms