Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DMAP28067 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DMAP28067 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms