Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms