Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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