Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms