Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms