Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF3P18847 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF3P18847 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms