Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREB1P16220 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms