Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFAP15692 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.4 ms