Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms