Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BMP3P12645 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BMP3P12645 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BMP3P12645 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BMP3P12645 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMP3P12645 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMP3P12645 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMP3P12645 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BMP3P12645 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms