Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM10L1P0DMW3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms