Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf89P0DMQ9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms