Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms