Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHA1P01876 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHA1P01876 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms