Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms